Действие разворачивается в постапокалиптическом мире, который сильно изменился за два столетия, пока Акира спал в криокапсуле. После масштабной техногенной войны привычные государственные образования исчезли, большую часть территории контролирует загадочная организация, о целях которой почти ничего не известно местным жителям.
